来自宇宙中的Bratcher星的拥有黑暗能量的三人组到达了地球，将能量附身于蒸汽机车上从而获得了拥有自我意识且可以变身的机械生命体，其为了实现“将世界笼罩在一片黑暗之中”的目的，决定首先以日本地区为中心展开他们的黑暗大作战。为了阻止这一邪恶野心，维护正义的火车侠们从Hikarian星远道而来，于是围绕着火车侠们与黑暗军团之间的正邪之争开始了。
听说慎邑私塾要新来一位老师，这位老师还是管子的后人，大家都十分紧张。一天，私塾来了一个白胡子老头和一名书童，大家理所当然地认为这就是新来的不管老师了。没想到，细心的甘罗发现，这老头举止十分蹊跷。经过一番勘察才知道，他们其实是两个江洋大盗——甄糊涂和贾机灵，那么，真正的老师又在哪里呢？原来，这其中，还有真正的老师设下的一个计谋……
无数细线横亘在星空之中，如同一把巨大的刷子。三体星舰队将于400年后抵达。遥远蝴蝶扇动着翅膀，也改变了罗辑的命运，轰然打开的门后是世界中心——面壁计划开启。同时，智子所创建的破壁室内，破壁人一一就位……
