故事發生在被選召的孩子們首次接觸數碼世界的6年後。2005年的一天，東京港區海面上的波浪在朝陽下搖曳……17歲的高中生八神太一，如常地用手按停眼前的鬧鐘，踢開混亂的被鋪，低聲滴咕下伸展四肢。拉開了窗簾，光線照到桌上一幅「那一天」的集體照上。隨後他在「一路順風，哥哥」的送別聲下，騎上腳踏車出門，奔向那片初夏的青空……現在，冒險再度進化……
两个单亲家庭的故事。艾普尔，臭虫（艾普尔的妹妹）和爸爸，原本是一个安静祥和的家庭，因为艾普尔的新男友本以及后来本的单亲妈妈的加入，跟艾普尔的爸爸发生的一些怪异微妙的关系，让处于青春期后期的艾普尔无所适从，导致她想尽全部办法极力阻挠，不过，经过种种艰难，他们最终还是幸福的生活了在一起。
1963年，一伙黑帮分子在老大的指使下将一对情人残忍杀害，男子被埋在“十世受苦，不得超生”的阴穴处；而女子被扒皮，皮罩在灯笼上，永世不得超生。
